故事发生在美丽的志摩市。因交通意外失去母亲的小男孩相泽透，一天在好奇心的驱使下，在海岛上找到一块闪烁着红光的石头，上面还有一枚蛋。刚握在手里，从蛋里竟孵出一只小乌龟来，为了纪念母亲生前对他的昵称，小透给小乌龟起名为“透透”，并瞒着父亲孝介把透透养在家里。　　平常在家里不爱说话的小透，由此一天天的开朗起来，这让孝介感到惊讶而欣慰。然而，事情并没有这么简单，这并不是普通的小乌龟，它不但生长速度惊人...

从未出现过的敌人开始出现在风都，而鸣海亚树子不知为何带走了照井龙的Accel驱动器以及Accel记忆体。在左翔太郎和菲利普的帮助下，照井龙开始探寻自己的过去，而在此期间他们与早已死去的鸣海庄吉产生了交集；另一边，鸿上基金会找到日本战国时期名将织田信长的坟墓，他们开始利用这难得的机会去实现他们图谋已久的目标，而无欲无求的青年、假面骑士OOO的变身者火野映司和他们的同伴们也开始注意到自己周围发生的异变...

第一部分：假面骑士Decade ～完结篇～　　骑士大战终于开始，世界的破坏者Decade将假面骑士们逐一打败。夏海为了阻止士而和KIVA-LA订下契约，变身为假面骑士KIVA-LA与Decade展开战斗。最终，KIVA-LA一剑刺穿了Decade……各骑士的世界恢复了原样，但Decade的世界却消失了。哀伤的众骑士一起回忆与士并肩作战的日子，而此时，过去的士从各人的回忆中复活！另一方面，超级死神博...

在风之街“风都”，左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后，神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。　　园咲家族的目的到底是什么？假面...

　　“流星塾”出身的“园田真理”，收到了来自父亲“花形”寄来的不明物品：“Faiz Gear和其专属机车”。为了问明父亲的用意，真理前往位于东京的巨大企业“SmartBrain”拜访父亲。途中遇上到处旅行的“干巧”，因真理放Faiz Gear的旅行袋和干巧被偷走的旅行袋一样而产生误会。正在争执的时候，两人被突然出现的不明怪物袭击．．．。　　“把Faiz腰带交出来！”　　另一边，“木场勇治”是一位家...